10月3日晚，臺“行政院長”唐飛因健康原因宣布辭職。唐飛下臺宣告了“全民政府”的破產，進一步加劇了島內民眾對陳水扁當局的信心危機，將對未來臺灣政局的發展產生復雜的影響。
　　
　　一、背景原因
　　
　　（1）唐飛是“全民政府”的替罪羔羊。起初，陳水扁籌組“全民政府”、選擇唐飛“組閣”，是基于穩定局勢、淡化各方矛盾等多種因素的考慮，也收到了一定的效果。然而，這種無視島內政黨政治的“全民政府”模式，存在著難以克服的體制矛盾和沖突，隨著時間的推移，“全民政府”這一畸型體制造成的亂象與惡果日益突顯，執政黨與新“政府”間黨政關系混亂、定位不明；“總統府”與“行政院”責權不清、協調失據；行政、立法兩院的對立與沖突日升；民進黨一些元老甚至預言“陳唐體制硬撐不到今年底”。而身為“行政院長”的唐飛則深陷各種矛盾與沖突的旋渦之中，既受制于“總統府”，又缺乏“立法院”中政黨的支持；既得不到國民黨的配合，又屢遭民進黨的炮轟，每每成為各方指責“全民政府”施政失誤的箭靶，輿論評價唐飛“做的很不尊嚴”，唐飛在四個月中已四次提出辭職，其無奈與無力感十分明顯，辭職只是時間早晚的問題。
　　
　　（2）陳、唐在“核四問題”上的沖突是唐飛下臺的導火索。
　　
　　早在“全民政府”成立之初，就有人預測國民黨籍“閣員”與民進黨存在根本的理念對立將引發重大的矛盾與沖突，“核四案”成為這一矛盾沖突最終爆發的導火線。“反核”是民進黨黨綱中僅次于“臺獨”的又一塊“神主牌”，9月以來，是否續建核四的問題在臺灣政壇引發重大爭議，民進黨堅持“反核”立場，陳水扁、謝長廷等也相繼表態在此問題上將遵守黨綱，而身為“行政院長”的唐飛一開始就明確了其一貫的“擁核”立場。唐飛在得到國民黨和親民黨支持的同時，卻遭到民進黨的強烈反對，民進黨秘書長吳乃仁屢屢炮轟唐飛，稱對唐“沒有信心、沒有期待”，“應該由民進黨人士組閣”。唐飛在核四問題上與陳水扁和民進黨立場的針鋒相對，使雙方的矛盾與沖突難以調和，失去模糊與回旋的空間走向最后攤牌。
　　
　　10月3日，“總統府”更以罕見的發表文字說明的方式，表示對唐飛關于推動核四的講話“訝異與困惑”，指其“違背兩周來扁唐會談的共識”；至此，陳水扁要唐飛走人的信息已較為明顯。但是，唐飛對此并無心理準備，當晚，他前往“總統府”與陳水扁進行例行餐會前，仍對陳有相當的信心，不料兩人見面后，陳便告知“你以前的辭呈我準了”。可見，唐飛是被陳水扁趕下臺的。
　　
　　二、初步影響
　　
　　（1）唐飛下臺宣告“全民政府”破局，民眾對新當局的信心危機進一步加劇。唐飛自5月20 日上任到下臺，任期僅有短短的137天，在這四個半月中，“全民政府”危機四伏，政經風波不斷。處于“總統府”、“行政院”、“立法院”和民進黨四方沖突角力的唐飛，最終只能成為最短命的“內閣”。唐飛的下臺無異宣告了“全民政府”體制的終結，驗證了不經政黨合作而籌組“少數執政內閣”的脆弱性。然而，陳水扁在唐飛下臺后，并未汲取教訓搞“聯合內閣”，預示著島內新一輪的激烈政爭即將開始。民眾對新當局的信心危機進一步加劇，對民進黨主導的“政府”發展經濟的能力缺乏信心。目前島內股市已從陳就職前的1萬點大跌到6千點左右。臺《聯合報》評論稱：“如果一個政府經常表現出在政治智慧上的根本偏差，及政治理性上的特殊偏執，如何不叫民眾提心吊膽”，“如今整個社會充滿的焦慮正是在此”。
　　
　　（2）民進黨“單獨執政”仍無法擺脫困境，其“臺獨”理念和政策將面臨更大的壓力。唐飛下臺后，陳水扁立即任命“行政院”副院長張俊雄接任，并對“行政院”進行小幅改組，表明臺灣政治體制已步入一個由民進黨單一少數政黨組成的“少數政府”的階段。陳水扁期望以此將“總統府”、“行政院”、“立法院黨團”和民進黨中央整合起來，以改變過去“全民政府”時期各說各話、協調不一的狀況。這種體制雖然可能會使黨政之間的矛盾和沖突減弱，民進黨高層屢屢炮轟“行政院長”的事情大為減少；但它仍無法改變其實力與權力不相符的事實與困境，未來“立法院”黨同伐異的情形將更為加劇；因此，其施政危機仍難以緩解。民進黨中央政策會執行長沈富雄稱：“現在府院更形一體，但國會形勢空前險峻”；前主席施明德也一針見血地批評，“少數政府和全民政府一樣行不通”。臺各種民意調查均顯示，張俊雄繼任“行政院長”無法穩定島內政局。如，臺TVBS電視臺10月4日發布的民調，對民進黨主導的“政府”沒信心的高達48%，有信心的僅占34%；對陳水扁的不滿意度達到47%。
　　
　　另一方面，由于唐飛的去職，使其原有的緩沖角色和民進黨的曖昧空間不復存在，民進黨被推到第一線，使得該黨的“臺獨”理念、黨綱、政策等都面臨是否要實踐還是轉型的考驗，成為引發未來島內政局和兩岸關系動蕩的隱患，兩岸關系發展的變數和“臺獨”的危險性由此進一步增大。
　　

（三）未來在野黨對新當局的制衡力度進一步增大。陳、唐之間的“同床異夢”雖然已經結束，但是引發政局動蕩的根源并未消失，反而預示著更大風暴的開始。過去在野黨對于唐飛的制衡多少還有些顧及情面，現在，這種競爭已經轉變為單純的政黨對抗；面對不帶雜質的民進黨執政團隊，面對未來日趨激烈的“立委”、縣市長選舉，國民黨、親民黨、新黨和民進黨之間的爭斗勢將更為激烈，其對臺當局的制衡力度也將進一步增大。以核四爭議為例，一向堅持續建核四的國民黨必然不會善罷甘休。島內輿論多認為，“唐飛辭職并未解決核四爭議，未來核四將更難處理，并深化朝野政黨對決”。對于下一年度的總預算審核等議題，國民黨和親民黨也都明確表達了強力制衡的立場。預計，到明年底的“立委”選舉前，島內政局依然政爭不斷，難以平靜。