爭出線：“獨派”杠上黨中央

　　蔡英文引領的民進黨中央，有意采行“完全民調”，并獲得新系、蘇系、謝系的跨派系支持。外界還來不及驚詫民進黨這種罕見的 “和諧”，黨內“獨派”、“公媽派”馬上跳出來激烈反對。
　　“獨派大佬”辜寬敏首先開炮：若采“完全民調”，他將脫離并退出民進黨！因為，若不能選擇自己的“總統”候選人，“身為黨員就沒有意義與價值”。隨后，辜寬敏辦公室執行長林宜正公開發表“弊大于利的全民調初選”新聞稿，將矛頭對準特定派系，預言他們要將“很不民進黨”的蔡英文塑造成“菁英獨裁者”。
　　呂秀蓮聯合“獨派立委”蔡同榮強硬要求提名納入黨員投票，還提出 “提名三部曲”，包括在各縣市巡回舉辦政見辯論會、黨員投票與民調三個階段。民進黨前主席姚嘉文反對“全民調”提名。

“民調派”：借機削弱“非新系”

　　一方面，在多次選舉中，民進黨屢屢出現黨員意見與“全民意志”相差甚遠的情況，黨內初選勝出者不見得能在一對一的最終對決中獲勝。以2008“總統”選舉為例，2007年蘇、謝之間展開初選之爭，結果黨員投票才剛起步，蘇、謝競爭立刻變調成“新系”與“反新系”的斗爭。最后在深綠與謝系的圍剿下，“新系”慘敗，蘇貞昌出局，但慘勝的謝長廷也沒能笑到最后。
　　另一方面，民進黨一直深受“人頭黨員”之苦。很多有意角逐公職者，都通過替黨員代繳黨費來掌握大批“人頭黨員”，用來操控初選結果，這已是民進黨內公開的秘密。但在“選罷法”修正后，政黨初選也納入約束，一旦“總統”和“立委”提名經黨員投票產生，民進黨的初選極有可能因此被檢警調等公權力介入。
　　2008年“大選”慘敗以后，民進黨透過“全代會”授權，將提名權交給“選戰策略小組”，開始以 “綜合協調、征召”取代“黨內初選”，“人頭黨員”在黨內提名中逐漸式微。蘇嘉宏認為，其實全民調、蔡英文、民進黨中央及“新潮流”這幾個名詞之間，完全可以劃上等號。“派系共治的情況下，新系的控制力會下降。通過全民調排除黨內意見，貫徹新系意志的民進黨中央，完全可以達到強干弱枝，斗垮謝系、蘇系的政治謀算”。