新冠病毒基因組演化分析和譜系劃分有重要進(jìn)展

　　科技日報(bào)昆明4月5日電 （記者趙漢斌）記者5日從中國科學(xué)院昆明動物研究所獲悉，該所與國內(nèi)多家研究機(jī)構(gòu)合作，解析了新型冠狀病毒基因組的演化規(guī)律，提出了具有層次結(jié)構(gòu)的譜系、亞譜系劃分系統(tǒng)。《科學(xué)通報(bào)》期刊發(fā)表了這一重要成果。

　　隨著感染人數(shù)增加，新冠病毒會快速發(fā)展出許多不同的株系。人類急需對這些新出現(xiàn)的變異進(jìn)行梳理與描述，并更加精細(xì)化地展示新冠病毒在人群中的演變軌跡。

　　中科院昆明動物研究所呂雪梅、張亞平課題組與北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院陸劍課題組、中國疾病預(yù)防控制中心譚文杰課題組等團(tuán)隊(duì)合作，分析了121618個(gè)高質(zhì)量病毒基因組中的單核苷酸變異，篩選出201個(gè)代表性單核苷酸變異，進(jìn)而逐級劃分出130個(gè)亞譜系，繪制成完整的反映各個(gè)譜系之間親緣關(guān)系的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖，同時(shí)建立了實(shí)時(shí)更新的配套網(wǎng)站以方便查看。

　　為闡明不同亞譜系病毒的流行程度是否有所不同，研究團(tuán)隊(duì)依據(jù)譜系劃分系統(tǒng)對有具體采樣時(shí)間信息的119168個(gè)高質(zhì)量病毒基因組進(jìn)行劃分，分析結(jié)果顯示，在地理?xiàng)l件、交通運(yùn)輸、文化風(fēng)俗、防疫政策、超級傳播者等各種因素共同作用下，病毒譜系在不同地域間有各自獨(dú)特的分布模式。

　　研究團(tuán)隊(duì)還收集了國內(nèi)從2020年4月到2021年1月的輸入病例數(shù)據(jù)，將其在譜系劃分系統(tǒng)單倍型網(wǎng)絡(luò)上進(jìn)行展示，可以為輸入型病例的來源提供推斷信息。

　　此項(xiàng)研究囊括了目前出現(xiàn)的絕大多數(shù)新冠基因組變異，并整理了其譜系關(guān)系，闡明各個(gè)譜系時(shí)空分布的規(guī)律，搭建出新冠病毒演化的大體框架，對理解病原體變異規(guī)律、新冠流行病學(xué)追蹤、預(yù)測病毒的演化方向有重要意義。