內(nèi)蒙古自治區(qū)境內(nèi)共有大小河流千余條,祖國(guó)的第二大河--黃河,由寧夏石咀山附近進(jìn)入內(nèi)蒙古，由南向北，圍繞鄂爾多斯高原，形成一個(gè)馬蹄形。其中流域面積在1000平方公里以上的河流有107條；流域面積大于300平方公里的有258條。有近千個(gè)大小湖泊。全區(qū)地表水資源為406.60億立方米，除黃河過(guò)境水外,境內(nèi)自產(chǎn)水源為371億立方米，占全國(guó)總水量的1.67％。地下水資源為139.35億立方米，占全國(guó)地下水資源的2.9％。扣除重復(fù)水量，全區(qū)水資源總量為545.95億立方米。年人均占有水量2 370立方米，耕地每公頃平均占有水量l萬(wàn)立方米，平均產(chǎn)水模數(shù)為4.4l萬(wàn)立方米／平方公里。內(nèi)蒙古水資源在地區(qū)、時(shí)程的分布上很不均勻，且與人口和耕地分布不相適應(yīng)。東部地區(qū)黑龍江流域土地面積占全區(qū)的27％，耕地面積占全區(qū)的20％，人口占全區(qū)的18％，而水資源總量占全區(qū)的65％，人均占有水量8 420立方米，為全區(qū)均值的3.6倍。中西部地區(qū)的西遼河、海灤河、黃河 3個(gè)流域總面積占全區(qū)的26％，耕地占全區(qū)的30％，人口占全區(qū)的66％，但水資源僅占全區(qū)25％，其中除黃河沿岸可利用部分過(guò)境水外，大部分地區(qū)水資源緊缺。
地表水 內(nèi)蒙古自治區(qū)平均地表年徑流量約291億立方米，占河川徑流總量的78％；多年平均徑流量為80億立方米，占河川徑流總量的22％。由于河川徑流受大氣降水及下墊面因素的影響，年徑流量地區(qū)分布不均，水資源也不平衡，局部地區(qū)水量富而有余，而大部分地區(qū)干旱缺水。同時(shí)，河川徑流年內(nèi)分布不均，年際間變化比較大。年降水集中在6～8月，汛期徑流量占全區(qū)徑流量的60～80% 。歷年間徑流量大小不勻，相差很大。年徑流量最大與最小的比值，東部林區(qū)各河流為4～12；中部各河流為6～22；西部地區(qū)各河流高達(dá)26以上。此外，從區(qū)外流入自治區(qū)境內(nèi)的河川徑流量有330.6億立方米，其中黃河入境的平均年徑流量315億立方米，額濟(jì)納河8.4 億立方米。
地下水 內(nèi)蒙古自治區(qū)地下水平均資源量為254億立方米。山丘區(qū)地下水平均年資源量為113億立方米，占全區(qū)地下水資源量44％。其中河川徑流量為80億立方米，占山丘區(qū)地下水資源量的7l％。平原區(qū)地下水平；均年資源量為172億立方米,扣除與山丘區(qū)地下水資源量的重復(fù)計(jì)算后,占全區(qū)地下水資源量的56％。自治區(qū)地下水資源的分布受大氣降水、下墊面條件和人類(lèi)活動(dòng)的影響，具有平原多、山丘區(qū)少和內(nèi)陸河流域更少的特點(diǎn)。自治區(qū)平原區(qū)扣除與山丘區(qū)地下水資源量間的重復(fù)計(jì)算后的地下水資源模數(shù)，一般在5.9～6.5萬(wàn)立方米／平方公里，為山丘區(qū)地下水平均水資源模數(shù)的2.2～2.7倍。內(nèi)陸河流域地下水資源模數(shù)為1.1萬(wàn)立方米／平方公里，因而地下水資源十分貧乏，只是在內(nèi)陸閉合盆地的平原或溝谷洼地，地下水才比較富集。全區(qū)按自然條件和水系的不同，分為：大興安嶺西麓黑龍江水系地區(qū)；呼倫貝爾高平原內(nèi)陸水系地區(qū)；大興安嶺東麓山地丘陵嫩江水系地區(qū)；西遼河平原遼河水系地區(qū)；陰山北麓內(nèi)蒙古高平原內(nèi)陸水系地區(qū)；陰山山地、海河、灤河水系地區(qū)；陰山南麓河套平原黃河水系地區(qū)；鄂爾多斯高平原水系地區(qū)；西部荒漠內(nèi)陸水系地區(qū)。
